В своем исследовании группа исследователей обследовала 33 здоровых взрослых участника. Одна группа из 22 добровольцев была изучена в течение сезона гриппа 2014-2015 гг., А вторая группа из 11 добровольцев была изучена в течение сезона гриппа 2015-2016 гг. Группа из 22 добровольцев имела ранее существовавший высокий иммунитет к штаммам вируса гриппа, содержащимся в вакцине от сезонного гриппа 2014-2015 гг. Группа из 11 добровольцев имела низкий иммунитет к штаммам вируса сезонной вакцины против гриппа 2015-2016 гг.
Все участники исследования получили вакцину от сезонного гриппа. Половина участников в каждой группе также прошли пятидневный курс приема антибиотиков широкого спектра действия (состоящий из неомицина, ванкомицина и метронидазола) перорально перед вакцинацией. Анализируя образцы стула и сыворотки крови, взятые в разное время в течение одного года после вакцинации, исследователи отслеживали иммунный ответ участников на вакцины против гриппа, а также разнообразие и численность организмов в микробиомах их кишечника.
Как и ожидалось, у большинства участников, получавших антибиотики, наблюдалось снижение уровня кишечных бактерий. Кроме того, среди участников 2015-2016 годов, у которых ранее не было иммунитета к вакцинным штаммам сезонного вируса гриппа, курс антибиотиков препятствовал их иммунным ответам на один из трех штаммов вируса гриппа в вакцине, вирус H1N1 A / Калифорния. По словам авторов, это, вероятно, указывает на то, что если они подвергнутся воздействию этого вируса H1N1 после вакцинации, эти участники будут менее защищены от заражения этим штаммом, чем люди, которые не получали антибиотики. Это открытие подтверждает более ранние результаты исследований на мышах.
Исследователи также обнаружили, что люди, принимавшие антибиотики, испытали изменения в своей иммунной системе, которые способствовали провоспалительному состоянию, аналогичному состоянию, наблюдаемому у пожилых людей, получивших вакцины от гриппа. Исследователи полагают, что это провоспалительное состояние связано с процессом, с помощью которого микробиом регулирует метаболизм желчной кислоты – при меньшем количестве микроорганизмов этот процесс нарушается.
Микробиомы людей естественным образом меняются с возрастом, и исследователи предполагают, что дальнейшие исследования этих путей могут дать представление о том, почему пожилые люди по-разному реагируют на вакцинацию от гриппа и почему у них в целом более слабая иммунная система.