«Слюна как образец для тестирования на COVID-19 изменила правила игры в нашей борьбе с пандемией. Это помогло нам повысить приверженность населения к тестированию, а также снизить риск воздействия на медицинских работников в процессе сбора данных ", – сказала ведущий исследователь Равиндра Колхе, доктор медицины, доктор философии, отделение патологии, Медицинский колледж Джорджии, Университет Августа, Огаста, Джорджия, США.
В исследование были включены образцы из больницы и дома престарелых, а также из центра проездных испытаний.
На первом этапе (протокол U) 240 подходящих пар образцов НПВ и слюны были проспективно протестированы на РНК SARS-CoV-2 с помощью ОТ-ПЦР. На втором этапе исследования (SalivaAll) 189 согласованных пар, в том числе 85, которые были ранее оценены по протоколу U, были обработаны в гомогенизаторе с шариковой мельницей Omni перед тестированием ОТ-ПЦР.
Дополнительное исследование было проведено с образцами как с протоколом U, так и с SalivaAll, чтобы определить, повлияет ли гомогенизация гранул на клиническую чувствительность образцов NPS. Наконец, была оценена стратегия объединения пяти выборок. Двадцать положительных пулов, содержащих один положительный и четыре отрицательных образца, были обработаны с помощью гомогенизатора шариков Omni перед объединением для тестирования SARS-CoV-2 RT-PCR и сравнены с контролями.
В фазе I, 28.3 процента образцов дали положительный результат на SARS-CoV-2 либо из НПВ, либо из слюны, либо из обоих. Уровень обнаружения был ниже в слюне по сравнению с NPS (50.0 процентов vs.
89.7 процентов). В Фазе II, 50.2 процента образцов дали положительный результат на SARS-CoV-2 либо из слюны, либо из NPS, либо из обоих. Уровень обнаружения был выше в слюне по сравнению с образцами NPS (97.8 процентов vs.
78.9 процентов). Из 85 образцов слюны, протестированных по обоим протоколам, уровень обнаружения составил 100 процентов для образцов, протестированных с помощью SalivaAll и 36.7 процентов с протоколом U.
Доктор. Колхе заметил, что основные проблемы, связанные с более низкой чувствительностью слюны к тестированию ОТ-ПЦР, могут быть связаны с гелеобразной консистенцией образцов слюны, что затрудняет точное внесение образцов пипеткой в планшеты для экстракции для экстракции нуклеиновых кислот.
Добавление этапа гомогенизации придало образцам слюны однородную вязкость и консистенцию, что упростило пипетирование для последующего анализа.
Доктор. Колхе и его коллеги также успешно проверили образцы слюны в стратегии объединения пяти образцов.
Объединенные результаты тестирования продемонстрировали положительное согласие в 95 процентов, а отрицательное согласие было установлено на 100 процентов. Объединенное тестирование будет иметь решающее значение для массового наблюдения за SARS-CoV-2, поскольку школы вновь открываются, возобновляются поездки и туризм, а люди возвращаются в офисы.
«Мониторинг SARS-CoV-2 останется необходимостью общественного здравоохранения», – сказал д-р. Колхе сказал. "Использование неинвазивного метода сбора и легкодоступного образца, такого как слюна, улучшит деятельность по скринингу и эпиднадзору и позволит избежать необходимости в стерильных мазках, дорогих транспортных средах и рисках заражения, и даже в квалифицированных медицинских работниках для сбора образцов."