Раскрытие генома в 3D-пространстве

Разрывы в нашей ДНК, которые могут возникать спонтанно или в результате облучения или химического воздействия, могут привести к серьезным проблемам, поскольку они вызывают мутации и в конечном итоге могут привести к раку. Но не каждый разрыв ДНК влечет за собой катастрофические последствия, поскольку у наших клеток есть гениальные способы восстановления повреждений. Один из основных путей репарации ДНК включает копирование недостающей информации о поврежденной ДНК из реплицированной сестринской хроматиды.

Чтобы это произошло, две молекулы ДНК сестринских хроматид должны находиться близко друг к другу в одном и том же геномном положении. Однако как две молекулы ДНК организованы относительно друг друга для поддержки этого важного пути восстановления, остается неясным.

Команда Дэниела Герлиха разработала метод, решающий эту проблему. "Современные методы картирования сворачивания ДНК имеют серьезное слепое пятно: они не могут различать идентичные копии молекул ДНК. Наш подход к решению этой проблемы заключался в том, чтобы маркировать копии ДНК таким образом, чтобы мы могли различать их с помощью секвенирования ДНК », – объясняет Майкл Миттер, докторант в Dr. Лаборатория Герлиха и первый автор текущей публикации в Nature.

Используя этот подход, исследователи смогли создать первую карту с высоким разрешением точек контакта между реплицированными хромосомами.
«С помощью этого нового метода мы теперь можем изучать молекулярный механизм, регулирующий конформацию сестринских хроматид, что даст представление о механике, лежащей в основе восстановления разрывов ДНК и образования палочковидных хромосом в делящихся клетках, что необходимо для правильного переносить геном в потомство клеток », – говорит Даниэль Герлих о проекте, который финансируется Венским фондом науки и технологий (WWTF) и является плодотворным сотрудничеством нескольких исследовательских групп в Венском биоцентре, в том числе лабораторий Амереса и Голобородько в IMBA. , и лаборатория Петерса в соседнем Институте молекулярной патологии (IMP).