На этой неделе в mSphere, журнале открытого доступа Американского общества микробиологов, исследователи описывают двухэтапный прогностический тест, который может помочь предсказать реакцию пациента на заражение SARS-CoV-2. Тест сочетает в себе оценку фактора риска заболевания с тестом на антитела, вырабатываемые на ранней стадии инфекции. По словам исследователей, его можно вводить во время постановки диагноза, чтобы помочь выбрать терапевтический подход до появления наиболее серьезных симптомов.
«Вы можете с очень высокой чувствительностью предсказать, что у кого-то будет тяжелый случай COVID-19», – сказала Эмили Сандерс, аспирантка лаборатории химического биолога Грегори Вайса, доктора философии.D, Калифорнийский университет в Ирвине. Сандерс руководил исследованием вместе с Санджаной Сен и Кристин Габриэль, также аспирантами лаборатории Вайса.
Большинство диагностических тестов ищут антитела, которые препятствуют распространению вируса. Вайс сказал, что группа изначально намеревалась разработать свою собственную диагностику, следуя той же стратегии, но быстро поняла, что скоро будет доступно множество конкурирующих тестов.
Вместо этого они сосредоточились на других, неизученных антителах, которые не обязательно разрушают вирус или помогают иммунной системе бороться с инфекцией.
«Все остальные искали хорошие антитела, которые нейтрализуют вирус», – сказал Вайс, старший автор исследования. "Мы недостаточно видели антитела, которые бесполезны."
«Возможность идентифицировать« плохой »ответ антител помогает заполнить пробел в исследованиях, – сказал Габриэль.
Предыдущие исследования предсказывали, что частица SARS-CoV-2 имеет более 55 эпитопов или сайтов на вирусе, где могут прикрепляться антитела. На сегодняшний день наиболее изученными эпитопами являются эпитопы, обнаруженные в белке S, или шипе, но у вируса есть еще три структурных белка, каждый из которых имеет эпитопы, достойные исследования, сказал Сен.
Используя ELISA или иммуноферментные анализы, исследователи составили список антител, которые могут коррелировать с худшим прогнозом, и в конечном итоге сосредоточились на антителах, которые прикрепляются к эпитопу 9 на N, или нуклеокапсиде, белке. Группа также разработала инструмент, в котором использовались данные о факторах, включая возраст, пол и ранее существовавшие состояния здоровья, для получения шкалы факторов риска заболевания (DRFS).
Они протестировали свой инструмент на группе из 86 человек с положительным результатом на коронавирус. Пациенты, тесты которых выявили наличие антител к эпитопу 9, имели больше шансов иметь длительное заболевание и худшие исходы, чем люди без антител. Из 23 человек в исследовании, у которых действительно были антитела, связанные с эпитопом 9, высокий DRFS предсказал тяжесть заболевания с чувствительностью более 92%.
По словам Вайса, в тесте используются технологии и инструменты, доступные в тестовых лабораториях. «Обнаружить антитела очень просто», – сказал он, и недорогой прогностический тест может помочь в принятии решений о лечении на ранних этапах прогрессирования заболевания.
Исследователи обнаружили, что антитела к эпитопу-9 становятся обнаруживаемыми через 1-6 дней после появления симптомов.
«У всех нас были друзья и родственники, затронутые этой болезнью, – сказал Вайс, – и мы хотели сделать что-то, что могло бы быть полезным, что могло бы помочь врачам, которые страдают от этого заболевания."