Однако эти тесты эффективности необходимы для эффективного лечения туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ-ТБ), который становится все более распространенным. В этих случаях возбудитель становится устойчивым, т.е.е. нечувствителен к лучшим противотуберкулезным препаратам, рифампицину и изониазиду. Это связано с изменениями в геноме, так называемыми мутациями, которые почти всегда происходят в одних и тех же точках генома.
Лечение МЛУ-ТБ длительное, дорогое и часто связано с побочными эффектами.
Для выбора антибиотиков в комбинированной терапии врачи до сих пор полагались на результаты теста на наркотики после культивирования. «В настоящее время доступно 15 препаратов для терапии второй линии, из которых по крайней мере четыре используются в комбинации», – поясняет проф. Кристоф Ланге, координатор клинического исследования в Исследовательском центре Борстель.
Чтобы ускорить выбор наиболее эффективных антибиотиков, ученые DZIF исследовательского центра Borstel под руководством проф. Стефан Ниманн, создал каталог мутаций в генетическом материале туберкулезных бактерий, который позволяет прогнозировать устойчивость бактерий к антибиотикам ко всем лекарствам. В отличие от многих других бактерий, генетический материал туберкулезных бактерий практически не меняется со временем.
Геном туберкулезных бактерий содержит примерно 4.4 миллиона строительных блоков (пар оснований), в которых хранится информация примерно для 4000 генов.
Ханс-Петер Гроббель, студент-медик и научный сотрудник DZIF в команде Кристофа Ланге, при поддержке своего сокурсника Никласа Колера, профессора Маттиаса Меркера, доктора Сонке Андрес и доктора Харальда Хоффманса, изучили результаты прогнозов устойчивости к антибиотикам с помощью общего анализа генома.
Используя туберкулезные бактерии от 70 пациентов с МЛУ-ТБ, лечившихся в Медицинском отделении Борстеля, исследователи сравнили молекулярное предсказание устойчивости к антибиотикам с фактическими результатами культуральных тестов. Их предоставил проф. Флориан Маурер, руководитель Национальной справочной лаборатории по туберкулезным бактериям в Борстеле. Ученые также изучили, можно ли составить надежные комбинации препаратов для лечения МЛУ-ТБ на основе прогнозов бактерий´генетический материал.
«Девяносто девять процентов всех препаратов в составе комбинированной терапии, которые мы собрали на основе результатов молекулярных предсказаний на основе генетического материала туберкулезных бактерий, также эффективны в соответствии с традиционными микробиологическими тестами на устойчивость к антибиотикам», – объясняет Гроббель. К настоящему времени молекулярные методы и дешевые, и быстрые.
В идеале пациенты могут получать индивидуализированное лечение МЛУ-ТБ уже в первую неделю после постановки диагноза туберкулеза.