«Новые варианты COVID-19 – это следующий новый рубеж», – сказал Адам Годзик, профессор биомедицинских наук в Медицинской школе Калифорнийского университета в Риверсайде и член исследовательской группы, которая сделала открытие. "Из них больше всего беспокоят сорта SA и Brazil. У них есть мутации, которые делают их устойчивыми к антителам, которые мы генерируем с помощью существующих вакцин. Принято считать, что мы находимся в напряженной гонке: если мы не вакцинируем людей быстро и не подавим пандемию, новые варианты будут преобладать до такой степени, что все наши вакцины против COVID-19 будут неэффективными."
Годзик и Аргаван Алисолтани-Дехкорди, постдокторский исследователь, который присоединился к его лаборатории два года назад, помогли охарактеризовать новый вариант SA, предоставив его структуру шипового белка с помощью компьютерного моделирования.
Результаты исследований сегодня появляются в журнале Nature.
Алисолтани-Дехкорди, которая до прихода в UCR была научным сотрудником Университета Кейптауна в Южной Африке, упомянула, что исследовательские группы из Университета Квазулу-Наталь в Южной Африке и Университета Кейптауна обнаружили новую линию происхождения – или вариант – SARS-CoV-2, вируса, вызывающего COVID-19, из образцов, собранных между октябрем. 15 и ноя. 25 февраля 2020 г., в трех провинциях ЮАР.
К началу ноября этот вариант быстро стал доминирующим в выборках из двух провинций.
«Каждый вариант SARS-CoV-2 имеет определенные мутации, определяющие его», – сказала Алисолтани-Дехкорди. "Профессор Годзик и я использовали компьютерное моделирование, чтобы предположить возможные структурные и функциональные последствия мутаций шипового белка в линии передачи SA.
Наш анализ, подтвержденный также несколькими другими исследовательскими группами, показывает, что некоторые мутации потенциально приводят к более высокой трансмиссивности вируса и более слабому иммунному ответу."
Вариант SA был обнаружен как минимум в 40 странах, включая США.
«Этот вариант, вероятно, распространяется в областях, где он не был секвенирован и, следовательно, не идентифицируется», – сказал Годзик. "В U.S., секвенирование – все еще медленный процесс. Во многих частях страны, включая Риверсайд, у нас нет никакой информации о вариантах."
Первоначальные исследования варианта SA показали, что он может быть устойчивым к антителам, что может снизить эффективность вакцин.
«Именно тогда он вызвал большой интерес», – сказал Годзик. "Последующие исследования подтвердили, что он устойчив к вакцинам и распространяется. Однако Южная Африка хорошо справляется с контролем этого варианта с помощью карантина и других мер."
Все недавно появившиеся варианты SARS-CoV-2, вызывающие озабоченность в Соединенном Королевстве, Южной Африке, Бразилии и Калифорнии, имеют общие мутационные сигнатуры.
Но каждый из этих вариантов также имеет уникальный набор мутаций. Например, варианты SA и Brazil имеют две уникальные мутации в шиповых белках K417N и E484K, соответственно.
«Наши предварительные результаты показывают, что некоторые из спайковых мутаций могут быть связаны с повышенной трансмиссивностью варианта SA», – сказал Алисолтани-Дехкорди. "Однако полное значение спайковых и других мутаций генома в этой новой линии еще предстоит определить. Следует подчеркнуть, что у нас недостаточно доказательств, подтверждающих более высокое прогрессирование, тяжесть или смертность заболевания, связанные с линией SA по сравнению с другими линиями. Но высокая трансмиссивность и необычная дивергенция линии SA и других недавно появившихся линий по сравнению с диким типом создают высокую потребность в систематическом надзоре за штаммами SARS-CoV-2 и раннем обнаружении вариантов до того, как они перерастут в вспышки."
Годзик объяснил, что не существует единственного вируса COVID-19.
Вместо этого существует популяция вирусов, которые постоянно развиваются. Варианты, которые также развиваются, приобретают мутации и могут подвергнуться вирусному ускользанию в любое время.
«Трудно сказать, что существует только один вариант SA», – сказал он. "Один из способов понять это – представить, что этот вариант представляет собой главную ветвь дерева, у которого много меньших ветвей. Некоторые из этих более мелких могут расти быстрее, чем другие, и приобретать большее значение.
Этот динамический процесс трудно предсказать."
Годзик предсказывает, что COVID-19 будет постоянным присутствием в нашей жизни, как и грипп.
«На разработку вакцины от гриппа уходит шесть месяцев», – сказал он. "Модели предсказывают эволюцию вируса гриппа, и вакцины производятся до того, как появятся варианты. Если прогнозы верны, вакцины работают.
Если они промахнутся, начнется тяжелый сезон гриппа. Вот как, скорее всего, поведет себя COVID-19. Много усилий будет вложено в прогнозирование того, что произойдет в следующем году, затем будут обновлены вакцины, и людям потребуется сделать повторную прививку."