Во главе с доктором. Милана Френкель-Моргенштерн, руководитель лаборатории онкологической геномики и биокомпьютинга сложных заболеваний на медицинском факультете Азриэли Университета Бар-Илан, исследователи использовали иммуноинформатический вычислительный подход для определения содержания белка в SARS-CoV-2 и впоследствии идентифицировали иммунодоминантный вирус. эпитопы вируса. Иммунные ответы, основанные на специфических иммунодоминантных эпитопах, включают в себя создание как антител, так и клеточного иммунитета против патогенов, представляющих такие эпитопы. Такой иммунитет может способствовать быстрому и эффективному устранению патогена.
Команда исследователей, в которую также входят Сумит Мукерджи, Дмитрий Творовски, Раджеш Детройа и Сунанда Бисвас Мукерджи, идентифицировала 15 потенциальных иммуногенных областей из трех белков SARS-CoV-2 и картировала 25 иммунодоминантных эпитопов на других белках SARS-CoV-2. Чтобы подтвердить, что эти эпитопы могут служить для обеспечения иммунитета глобальной популяции, был определен процент людей, которые экспрессируют главный комплекс гистосовместимости (MHC), способных распознавать любой из этих эпитопов. Соответственно, считалось, что семь эпитопов присутствуют у более чем 87% мирового населения, пораженного вирусом. Дальнейшие структурные молекулярные док-анализы позволили оценить связывающее взаимодействие этих потенциальных эпитопов с человеческим MHC.
Были созданы полные списки белков MHC, которые распознают каждый эпитоп, они представлены как в представленной рукописи, так и в предварительной заявке на патент США (US 63/034.416).
Семь эпитопов были протестированы с использованием нескольких инструментов для проверки их неаллергенной и нетоксичной природы, а также для демонстрации того, что они несут низкий риск запуска любых аутоиммунных реакций.
Вместе такие результаты показывают, что эти семь эпитопов представляют собой потенциально эффективные вакцины-кандидаты. Действительно, разработка вакцин с использованием этих иммунодоминантных эпитопов могла бы активировать как гуморальные, так и клеточные иммунные ответы у людей, составляющих основную часть населения мира.