Ведущий исследователь Куртин, кандидат наук Мике ван дер Хейде, из Центра восстановления рудников ARC, сказала, что метабаркодирование ДНК – это растущая область в области биологического мониторинга, способная обеспечить быструю, точную и экономичную оценку биоразнообразия.
«Традиционно биомониторинг полагался на ученых, устанавливающих ловушки и визуального мониторинга определенной области, подсчета количества видов, а затем экстраполяции этих данных для проведения регионального анализа», – сказала г-жа ван дер Хейде.
"Понятно, что этот метод сбора данных является дорогостоящим, трудоемким и сложным, особенно при изучении отдаленных районов Австралии, которые часто имеют суровый климат.
"Когда животные и организмы взаимодействуют с окружающей средой, они оставляют следы своей ДНК в таких вещах, как помет, клетки кожи, слюна и пыльца. Когда эта ДНК обнаруживается в окружающей среде, она известна как экологическая ДНК или эДНК.
«Наше исследование изучило возможность использования этой эДНК в качестве дополнительного инструмента для биомониторинга.
Не только для того, чтобы увидеть, может ли этот тип анализа потенциально облегчить жизнь биологам в полевых условиях, но и для того, чтобы предоставить исследователям более точную полевую информацию, чем то, что они могут визуально идентифицировать."
В ходе исследования были проанализированы образцы почвы, помета животных, растений и насекомых, вместе известных как «субстраты», взятые из двух разных областей Западной Австралии: Пилбара, жаркий климат пустыни, и Лебединая прибрежная равнина, жаркая средиземноморская местность. климат.
«Мы протестировали общие природные субстраты, включая почву, насыпь, насыпной растительный материал и насыпные членистоногие из ловушек и лопастных ловушек, используя четыре оценки штрих-кодирования eDNA для обнаружения широкого спектра растений, позвоночных и членистоногих», – сказала г-жа ван дер Хейде
«Это исследование было первым в своем роде, в котором проводилось систематическое тестирование наземных субстратов на наличие еДНК, а также впервые были проанализированы некоторые из этих конкретных субстратов.
"Результаты показывают, что в большом количестве членистоногих и экскрементах животных обнаружено наибольшее биоразнообразие, причем не менее трети биоразнообразия обнаружено только в одном субстрате. Образцы почвы обнаруживаются меньше всего, и меньше образцов содержат пригодную для использования ДНК, особенно в Пилбаре.
Мы считаем, что это, скорее всего, связано с жарким климатом, который потенциально разрушил eDNA.
«Биомониторинг необходим для эффективного управления экосистемой. Наше исследование показывает, что электронная ДНК может обнаруживать биоразнообразие на территории, а сбор большего количества субстратов увеличит масштабы обнаруживаемого биоразнообразия.
«Тем не менее, исследования должны быть тщательно продуманы, поскольку ДНК может поступать от организмов за пределами области исследования», – сказала г-жа ван дер Хейде.
Это исследование было завершено в лаборатории Trace and Environment DNA (TrEnD) в кампусе Кертинского университета в Перте.