Совместное исследование Университета Британской Колумбии (UBC) и Стратегической инициативы по охране здоровья лосося (SSHI) – партнерства между Fisheries and Oceans Canada (DFO), Genome BC и Pacific Salmon Foundation – прослеживает происхождение PRV до Атлантики. лососевых ферм в Норвегии и обнаружил, что вирус теперь почти повсеместен на лососевых фермах в B.C.
Это также показывает, что дикий лосось чавычи с большей вероятностью будет инфицирован PRV, чем ближе они к лососевым фермам, что позволяет предположить, что фермы передают вирус дикому лососю.
Секвенирование генома вирусов с ферм и дикой рыбы также указывает на то, что передача происходит от ферм к дикому лососю.
«Как наши геномные, так и эпидемиологические методы независимо друг от друга пришли к одному и тому же выводу, что лососевые фермы действуют как источник и усилитель передачи PRV», – сказал д-р.
Гидеон Мордехай, вирусный эколог и сотрудник Liber Ero из UBC Science и исследователь из UBC Medicine, который руководил исследованием. "Поскольку отдельные строки независимых свидетельств указывают на один и тот же ответ, мы уверены в своем выводе."
Секвенирование 86 геномов PRV помогло исследователям отследить историю появления PRV в Британской Колумбии.
По их оценкам, линия PRV в северо-восточной части Тихого океана отделилась от PRV в Атлантическом океане примерно 30 лет назад. Это говорит о том, что введение PRV в B.C. и заражение дикого тихоокеанского лосося – относительно недавнее явление, совпадающее с ростом аквакультуры лосося в провинции – не относящееся к ранним попыткам завезти атлантического лосося в регион, начиная с 1874 года.
«Существует большая путаница в отношении того, откуда происходит PRV, передается ли он между выращиваемым и диким лососем, и как разные линии вируса вызывают разную степень тяжести заболевания», – сказал доктор. Мардохей. "Секвенирование генома этого исследования ясно указывает на то, что PRV не является естественным для B.C. воды – он возник в Атлантическом океане и распространился по всему миру благодаря аквакультуре лосося."
В исследовании подчеркивается роль аквакультуры в занесении новых патогенов в новые регионы, где они затем распространяются на диких рыб, и объединяется опыт двух старших авторов, доктора. Кристи Миллер, ученый DFO и профессор Джеффри Джой, эволюционный генетик UBC.
Он демонстрирует ценность геномики в надзоре за вирусными патогенами, влияющими на важные рыбные ресурсы, и то, как аналитические методы, полученные на основе эпидемиологии вирусов человека, могут быть адаптированы и применены для сохранения популяций дикого лосося.
Дальнейший анализ геномов PRV, полученных в ходе исследования, показал, что наблюдается рост числа инфекций PRV в группе B.C. за последние десятилетия.
Этот результат соответствует региональному росту аквакультуры лосося и высоким уровням вирусной инфекции на лососевых фермах.
«Наш вывод о том, что PRV передается между выращиваемым и диким лососем, особенно актуален с учетом недавних полевых и лабораторных исследований, показывающих происхождение PRV в B.C. может вызвать заболевание как у тихоокеанского, так и у атлантического лосося ", – говорит д-р. Мардохей.
Недавнее норвежское исследование показало, что канадский изолят вируса вызывает поражение сердца у атлантического лосося. Что еще более важно для экосистемы Тихого океана, PRV была связана с другим заболеванием у чавычи лосося, при котором клетки крови разрываются, что приводит к повреждению почек и печени. Это контрастирует с оценкой DFO, согласно которой PRV не является возбудителем болезни.
«Наше исследование подтверждает, что более осторожный подход к управлению выращиванием лосося в Британской Колумбии оправдан», – говорит соавтор исследования д-р.
Эндрю Бейтман, Фонд тихоокеанского лосося. «Результаты PRV, в частности, поддерживают призывы к переходу от разведения лосося с открытой сеткой к технологии разведения, которая не допускает передачи болезней между выращиваемым и диким лососем, защищая дикого тихоокеанского лосося Британской Колумбии от серьезного риска в этом процессе."
«Исследование предоставляет основополагающую информацию, необходимую для оценки риска аквакультуры лосося на дикой рыбе, в соответствии с рекомендациями Генерального аудитора Канадского отчета по выращиванию лосося за 2018 год, в котором критиковалась способность DFO управлять аквакультурой с осторожностью», – говорит профессор Джеффри Хатчингс из Университет Далхаузи, ведущий канадский ученый-рыболов, не участвовавший в исследовании. «Работа Мордекая, Миллера и его коллег по PRV предоставляет наиболее убедительные, научно объективные доказательства того, что дикий лосось в Британской Колумбии подвержен повышенному риску заболеваний из-за аквакультуры атлантического лосося с открытой сеткой», – добавляет профессор Хатчингс.